影片主要讲述了在中国少林寺附近有一个武术学校，有一个天才少年（张壮饰演）为了获得南平拳的绝艺，打败了许多对手，但最后的对手却在日本。于是，功夫小子来到日本，与太极拳传人（泉平子饰演）相遇，同时，发现了黑文部博臣（西村雅彦饰演）领导的‘黑文部省’侵占日本文部省乃至统治整个国家的阴谋活动，其实黑文部博臣就是功夫小子的最后对手。在泉和玲子（藤本七海）等孩子们的帮助下，打败了最后的对手，战胜了‘黑文部省’，保卫了日本的文部省和日本的和平。功夫小子最后回到了中国，获得了南平拳绝艺故事。