变形金刚领袖的挑战动画故事讲述了一艘狂派运囚船坠落在地球上，擎天柱召唤大黄蜂来领导一支由散兵游勇组成的队伍，包括一个反叛的坏小子，一个循规蹈矩的精英卫队学员，一只嗓门超大的机器恐龙和一个亢奋过度的迷你金刚。这位新英雄很快就意识到，追捕敌人是件苦差事，但与这样一群与众不同的队员合作，恐怕才是更难的事情！他们的任务是：将所有脱逃的狂派恶棍捉拿归案，以及当然是拯救人类。问题是大黄蜂必须先学会如何领导！