本动画根据日本漫画家藤子不二雄A的漫画同名代表作《忍者哈特利》改编，主角哈特利是一名修行中的少年忍者，从伊贺到东京，寄居在三叶家中所发生的故事。故事描写哈特利与男孩三叶健一的友情，并介绍（或创作）了不同的忍术。