舞台是继『遥远时空中2』后又过了大约100年的异世界。主角春日望美是个普通的高中生少女，却因邂逅一名奇怪的少年，被选为『白龙的神子』，穿越时空移动到了正在展开源平之战的另一个世界。主角在那里受到源氏军队的保护，并得知为了回到原来的世界，必须封印怨灵，提高龙神的力量。而制造与控制怨灵的正是平家，就这样，主角被卷入了与平家的战争。