该片以热带雨林为故事背景，讲述了马诺一行人为了寻找兰欣儿的爸爸兰博士，前往丛林的心脏砂拉越。刚到塔鲁曼，他们就被那的守护神强行带到了塔鲁曼的入口处，马诺和丁凯本想要借助灵兽的力量来与守护神进行抗衡，却无奈被神奇的力量瞬间移动了……在一路上，他们又遇到了越来越多强大的灵兽，还有驯兽师派来的黑色精灵暗煜与假面三人不断制造各种麻烦。丁凯决定独自离开，而后又回来抢夺马诺手中的灵兽，一心想让阿瑟变为完全体……在大家经历了危险、分离、挣扎、走散、重聚等一系列事件后最终成功走出困境，救出兰欣儿和丁凯的爸爸，使丛林得到了拯救并重获生机。